1)İşler Değişir

2)Daha İyi Bir Fare Kapanı

3)Mouserların Saldırısı

4)Casey Jones ile Tanışın

5)Nano

6)Şehrin Kenarında Karanlık

7)Görünmezlik Yolu

8)Düşen Melek

9)Çöp Adam

10)Shredder'ın Saldırısı, Bölüm 1

11)Shredder'ın Saldırısı, Bölüm 2

12)İkna Edici Titan Kaplumbağa

13)Yeraltından Notlar, Bölüm 1

14)Yeraltından Notlar, Bölüm 2

15)Yeraltından Notlar, Bölüm 3

16)Kral

17)Shredder'ın Dönüşü, Bölüm 1

18)Shredder'ın Dönüşü, Bölüm 2

19)Masal

20)Canavar Avcısı

21)New York'a Dönüş, Bölüm 1

22)New York'a Dönüş, Bölüm 2

23)New York'a Dönüş, Bölüm 3

24)Yalnız Raph ve Evlatları

25)Kıymık Arama, Bölüm 1

26)Kıymık Arama, Bölüm 2

27)Kaplumbağalar Uzayda Bölüm 1: Fugitoid

28)Kaplumbağalar Uzayda Bölüm 2: Triceratonlar ile Sorun

29)Kaplumbağalar Uzayda Bölüm 3: Cezaevi

30)Kaplumbağalar Uzayda Bölüm 4: Arena

31)Kaplumbağalar Uzayda Bölüm 5: Triceraton Savaşları

32)Gizli Kökenler Bölüm 1

33)Gizli Kökenler Bölüm 2

34)Gizli Kökenler Bölüm 3

35)En Güçlü Ninja

36)Yansımalar

37)Nano'nun Dönüşü

38)Müthiş Timsah

39)Yer Altına Dönüş

40)Şehir Savaşı 1.Bölüm

41)Şehir Savaşı 2.Bölüm

42)Şehir Savaşı 3.Bölüm

43)Junklantis

44)Altın Disk

45)Evdeki Rogue, Bölüm 1

46)Evdeki Rogue, Bölüm 2

47)Nisan

48)Adalet Gücünün Dönüşü

49)Büyük Kavga 1.Bölüm

50)Büyük Kavga 2.Bölüm

51)Büyük Kavga 3.Bölüm

52)Büyük Kavga 4.Bölüm

53)Uzay İstilacıları, Bölüm 1

54)Uzay İstilacıları, Bölüm 2

55)Uzay İstilacıları, Bölüm 3

56)Dünyalar Çarpışıyor, Bölüm 1

57)Dünyalar Çarpışıyor, Bölüm 2

58)Dünyalar Çarpışıyor, Bölüm 3

59)Dokun ve Git

60)Avlandı

61)Nefret

62)Kandırılmaz

63)Ders

64)Yılbaşı

65)Yeni Kan

66)İçindeki Karanlık

67)Yer Çekimi Görevi

68)Aşağıdaki Varlık

69)Zaman Yolları

70)Koşu

71)Gerçeklik Kontrolü

72)Tüm Evrende

73)Hiç Olmadığı Kadar

74)Gerçek Dünya, Bölüm 1

75)Gerçek Dünya, Bölüm 2

76)Piskoposun Gambiti

77)Çıkış, Bölüm 1

78)Çıkış, Bölüm 2

79)Kuzen Sid

80)Halkın Seçimi

81)Sessiz Çağın Oğulları

82)Ejderha

83)Ben, Canavar

84)Kin Maçı

85)Bir Kanat ve Dua

86)Kötü Gün

87)Aramızdaki Uzaylılar

89)Kimse

90)Hırsızlar

91)Samuray Turist

92)Eski Bir

93)Shredder'ın Evladı

94)Müsrif Oğlu

95)Salgın

96)Augie ile Sorun

97)Deli

98)Savanti'nin Dönüşü, Bölüm 1

99)Savanti'nin Dönüşü, Bölüm 2

100)Usta Yoshi'nin Öyküsü

101)Kaplumbağa Oturan Maceralar

102)İyi Genler, Bölüm 1

103)İyi Genler, Bölüm 2

104)Ninja Mahkemesi

105)Tanrıların Kucağı

106)Şeytanlar ve Ejderhalar

107)5 Ejderha Efsanesi

108)Birden Fazla Dünya

109)Sonun Başlangıcı

110)Sürücü

111)Yeni Dünya Düzeni, Bölüm 1

112)Yeni Dünya Düzeni, Bölüm 2

113)Babalar ve Oğullar

114)Geçmiş ve Şimdiki

115)Ejderhaların Girişi, Bölüm 1

116)Ejderhaların Girişi, Bölüm 2